120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2533 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
192 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  37.96 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  33.04 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  30.95 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  32.14 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.64 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.43 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  33.58 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  32.74 
 
 
261 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
204 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
202 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
307 aa  58.2  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
245 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
361 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  33.83 
 
 
188 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
680 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
1252 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 
766 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
1252 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
564 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  25 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
1827 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  32.26 
 
 
979 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.66 
 
 
622 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
512 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1192 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  27.96 
 
 
832 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.6 
 
 
764 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
543 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.12 
 
 
417 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.47 
 
 
730 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.74 
 
 
1979 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.4 
 
 
1694 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
3145 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
1276 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
711 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
750 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
329 aa  45.1  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
279 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.65 
 
 
479 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
1737 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
291 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.31 
 
 
266 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.84 
 
 
397 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
523 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.21 
 
 
916 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 
643 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
404 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.03 
 
 
462 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
789 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
784 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  32.05 
 
 
917 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  23.26 
 
 
1014 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
649 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29 
 
 
681 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.66 
 
 
725 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  25 
 
 
706 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
927 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
1276 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.41 
 
 
340 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.74 
 
 
635 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
942 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  29.36 
 
 
415 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
1486 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  24.18 
 
 
623 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
699 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1178 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 
344 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
344 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.61 
 
 
1138 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  27.71 
 
 
772 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
3301 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
3035 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
301 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 
371 aa  42  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
265 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
716 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>