174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2290 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  40.08 
 
 
268 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  38.57 
 
 
282 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  38.34 
 
 
259 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  40.94 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  34.12 
 
 
282 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  39.01 
 
 
282 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  35.51 
 
 
254 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  30.56 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  35.1 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  38.74 
 
 
258 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  42.35 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  36.93 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  38.01 
 
 
259 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  33.49 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  33.95 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  33.47 
 
 
246 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  40.1 
 
 
259 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.89 
 
 
242 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  35.94 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  32.13 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  32.42 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  37.94 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  37.94 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  37.8 
 
 
264 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  39.18 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  35.81 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  36.84 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  38.98 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  37.37 
 
 
244 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  34.72 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  36.84 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  32.43 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  31.75 
 
 
248 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.42 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.31 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  32.56 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.19 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.64 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  31.98 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  31.08 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  34.04 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  31.37 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  31.08 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  32.39 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  31.13 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.62 
 
 
280 aa  79  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.29 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.41 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  30.89 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  32.13 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.83 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.59 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.59 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  29.25 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.59 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  33.48 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.03 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  35.23 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.8 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  34.21 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0787  hypothetical protein  65.38 
 
 
56 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.599159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  36.46 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.02 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  34.98 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  30.68 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.57 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  28 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  34.03 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  34.77 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  34.89 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  28.52 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.43 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  27.89 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.13 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.44 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.57 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  31.94 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.45 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  27.09 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.17 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  28.91 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.13 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.74 
 
 
265 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>