More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1538 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  46.65 
 
 
947 aa  822    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  52.72 
 
 
963 aa  1034    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  58.99 
 
 
964 aa  1155    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  47.31 
 
 
966 aa  879    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  45.31 
 
 
932 aa  790    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  44.48 
 
 
960 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  47.62 
 
 
942 aa  876    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  41.25 
 
 
961 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  60.53 
 
 
665 aa  843    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  54.57 
 
 
975 aa  1050    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  44.93 
 
 
929 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  100 
 
 
963 aa  1972    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.93 
 
 
961 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  45.28 
 
 
949 aa  840    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  41.06 
 
 
951 aa  705    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  46.69 
 
 
967 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  58.13 
 
 
955 aa  1147    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  47.03 
 
 
921 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  46.46 
 
 
915 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  46.46 
 
 
916 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  46.46 
 
 
915 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.12 
 
 
584 aa  216  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  29.21 
 
 
584 aa  213  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  29.27 
 
 
572 aa  206  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  29.22 
 
 
560 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  29.22 
 
 
560 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  29.22 
 
 
560 aa  205  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  29.22 
 
 
560 aa  205  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  29.22 
 
 
560 aa  205  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  29.22 
 
 
560 aa  205  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
560 aa  204  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  29.22 
 
 
560 aa  204  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
941 aa  203  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
941 aa  203  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.15 
 
 
988 aa  197  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.7 
 
 
555 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.65 
 
 
1145 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  28.88 
 
 
560 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.64 
 
 
966 aa  191  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 
962 aa  190  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.12 
 
 
1144 aa  188  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.12 
 
 
835 aa  188  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.9 
 
 
1138 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  34.31 
 
 
363 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
933 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.92 
 
 
467 aa  185  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.31 
 
 
972 aa  186  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.41 
 
 
969 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.09 
 
 
969 aa  184  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 
1129 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.93 
 
 
1062 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
1116 aa  176  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.67 
 
 
971 aa  171  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
1147 aa  170  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  26.4 
 
 
1037 aa  170  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.5 
 
 
1170 aa  168  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.83 
 
 
1170 aa  168  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  25.77 
 
 
1201 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 
1201 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
964 aa  163  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.39 
 
 
801 aa  161  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 
1046 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  26.81 
 
 
922 aa  157  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 
877 aa  157  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  27.62 
 
 
1169 aa  156  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  26.44 
 
 
925 aa  156  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
1167 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.67 
 
 
1057 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.87 
 
 
1095 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.54 
 
 
1028 aa  155  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
1169 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.1 
 
 
1194 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.39 
 
 
805 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.17 
 
 
1160 aa  154  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1167 aa  154  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.98 
 
 
1170 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  26.79 
 
 
1167 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.21 
 
 
1165 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 
1172 aa  151  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.97 
 
 
1168 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.41 
 
 
1038 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  27.48 
 
 
1172 aa  148  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.06 
 
 
927 aa  146  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  27.63 
 
 
1044 aa  144  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.09 
 
 
1160 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  26.51 
 
 
1137 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 
937 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.19 
 
 
1170 aa  137  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  25.49 
 
 
1136 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  25.67 
 
 
829 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  25.31 
 
 
1058 aa  131  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.34 
 
 
894 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
1031 aa  127  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  25.59 
 
 
1069 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  25.59 
 
 
1069 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  32.54 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  25.48 
 
 
1049 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.45 
 
 
900 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  24.77 
 
 
1046 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  25.69 
 
 
1045 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>