296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1748 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1748  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  635    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  27.19 
 
 
366 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  33.62 
 
 
446 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  32.14 
 
 
745 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.48 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 
198 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  31.39 
 
 
776 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  31.93 
 
 
386 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  38.95 
 
 
442 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  31.62 
 
 
416 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.39 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.45 
 
 
727 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.33 
 
 
576 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  34.45 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.37 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  28.7 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
567 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
309 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  31.13 
 
 
225 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 
184 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 
493 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  33.58 
 
 
204 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 
862 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.79 
 
 
489 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 
441 aa  55.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 
418 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  36.56 
 
 
734 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.1 
 
 
14916 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.42 
 
 
450 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.62 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 
433 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
866 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 
172 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.41 
 
 
234 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 
179 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 
216 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  30.18 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.36 
 
 
447 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 
448 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 
485 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  36.89 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 
493 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
225 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.42 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  35.87 
 
 
168 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  44.93 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  28.4 
 
 
291 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  32.38 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 
453 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  28.4 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  37.17 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  34 
 
 
180 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 
176 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 
176 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 
174 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.62 
 
 
452 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  34.65 
 
 
961 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 
215 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  28.4 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  28.79 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  36.62 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  28.4 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  26.06 
 
 
366 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  33.06 
 
 
175 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
710 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.44 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  31.73 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  35.58 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 
182 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  32.98 
 
 
217 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
449 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  41.89 
 
 
830 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.89 
 
 
525 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  26.83 
 
 
366 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  41.89 
 
 
830 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>