More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4133 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 497 aa  999    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 512 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 503 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  31.91 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  31.91 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  31.91 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 546 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 546 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.32 
 
 		 543 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.95 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 541 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.77 
 
 		 547 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.76 
 
 		 547 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  30.25 
 
 		 555 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.73 
 
 		 539 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.49 
 
 		 513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.81 
 
 		 547 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.39 
 
 		 547 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  28.79 
 
 		 548 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  28.98 
 
 		 566 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  28.79 
 
 		 548 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  28.98 
 
 		 566 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.51 
 
 		 547 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.07 
 
 		 1004 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 548 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  28.41 
 
 		 546 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.81 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 534 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.42 
 
 		 550 aa  190  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  28.29 
 
 		 543 aa  189  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.08 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3482  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753738  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3471  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3534  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 527 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.75 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 526 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.76 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.12 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 533 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  30.91 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4061  AMP-dependent synthetase and ligase  33.41 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  30.6 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 489 aa  172  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 		 519 aa  170  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 534 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  31.09 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.39 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  29.73 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 522 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.72 
 
 		 524 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  29.55 
 
 		 504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  30.26 
 
 		 503 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 496 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.34 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  27.44 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.06 
 
 		 538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.06 
 
 		 538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  30.4 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.18 
 
 		 512 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.1 
 
 		 538 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0025  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  29.61 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.06 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  29.24 
 
 		 515 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  31.63 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.06 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 482 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.4 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 630 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 482 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 		 522 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.98 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 557 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.82 
 
 		 538 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 501 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.03 
 
 		 538 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>