296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3089 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3089  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.231673  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2581  ABC-2 type transporter  52.69 
 
 
289 aa  314  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0847  polysaccharide ABC transporter, permease  47.7 
 
 
283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0287089  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2433  ABC-2 type transporter  45.3 
 
 
287 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0840786  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3894  ABC-2 type transporter  46.81 
 
 
287 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0406  ABC-2 type transporter  46.71 
 
 
292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2027  ABC-2 type transporter  41.64 
 
 
288 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514923  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1416  ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
283 aa  225  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0327  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3245  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07235  ABC transporter, permease protein  44 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  39.58 
 
 
286 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1034  ABC-2 type transporter  38.32 
 
 
282 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4621  ABC-2 type transporter  33.68 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1761  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 
282 aa  191  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.423891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1588  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 
269 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1558  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2173  ABC-2 type transporter  37.2 
 
 
281 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0652138  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2803  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 
295 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0189  ABC-2 type transporter  35.61 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0194  ABC-2 type transporter  35.61 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0841  polysaccharide ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2109  ABC-2 type transporter  35.88 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4945  ABC-2 type transporter  34.09 
 
 
279 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2359  ABC-2 type transporter  34.19 
 
 
282 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5770  ABC-2 type transporter  33.71 
 
 
277 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3355  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 
276 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1674  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1646  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 
279 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1504  ABC transporter permease  31.8 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4903  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
278 aa  160  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0837  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  34.23 
 
 
283 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0813  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzm  34.23 
 
 
283 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1724  ABC-2 type transporter  32.64 
 
 
274 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  0.0420045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0626  carbohydrate ABC-transporter, permease protein, putative  34.48 
 
 
275 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1406  hypothetical protein  34.5 
 
 
276 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.23309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2771  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 
277 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3132  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 
570 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2701  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
274 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00525634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2896  ABC transporter permease  32.95 
 
 
335 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2570  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
279 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0125622  normal  0.492528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2771  ABC-2 type transporter  33.09 
 
 
277 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.588379  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0349  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
328 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1103  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
275 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1269  hypothetical protein  30.08 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0751475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0506  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
258 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2268  O-antigen export system permease protein RfbA  31.98 
 
 
259 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.259861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4466  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
478 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0052  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 
263 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5684  hypothetical protein  30.57 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0450  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6241  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  29.18 
 
 
265 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0766  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 
264 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0395  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3871  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1405  ABC-2 type transporter  29 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.842674  normal  0.590881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0660  hypothetical protein  28.63 
 
 
237 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000211424  hitchhiker  0.000000177983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0576  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0565  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 
263 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4189  hypothetical protein  26.85 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71960  membrane subunit of A-band LPS efflux transporter  28.76 
 
 
265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1065  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.277527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2171  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.637351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1363  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
284 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.521768  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0917  hypothetical protein  25.76 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3031  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 
294 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5890  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 
310 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.706739  normal  0.557903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2756  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
633 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3650  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 
283 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.537314  normal  0.17374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3367  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 
604 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0747872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4096  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
283 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00286363  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4205  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 
277 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.145294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2516  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 
273 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4139  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 
606 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.795712  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1397  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 
283 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00114129  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1748  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 
316 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0650  ABC polysaccharide efflux pump, inner membrane subunit  29.18 
 
 
257 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.414968  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0275  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1551  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5679  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1493  ABC-2 type transporter  30 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.121302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3461  ABC-2 type transporter permease protein  27.31 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273257  normal  0.0897342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1778  lipopolysaccharide ABC export system, permease protein  27.89 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.324664  decreased coverage  0.00255236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0544  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.466883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1239  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4049  hypothetical protein  26.7 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448399  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2462  ABC transporter, inner membrane subunit  29.18 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08840  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.55 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.704211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3547  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.383437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3693  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5477  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1681  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
298 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3346  hypothetical protein  28.22 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0366405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20830  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.89 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0724  hypothetical protein  27.48 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432005  normal  0.438264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1863  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1889  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2538  lipopolysaccharide exporter  21.82 
 
 
276 aa  89.7  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.094408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2314  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0420  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
268 aa  88.6  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>