More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3084 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 506 aa  1014    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  86.41 
 
 		 521 aa  898    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  87.57 
 
 		 521 aa  907    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  86.41 
 
 		 521 aa  898    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  59.31 
 
 		 538 aa  581  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  58.45 
 
 		 562 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  46.65 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  45.05 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  43.48 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  41.76 
 
 		 549 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  30.99 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 		 494 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  29.67 
 
 		 527 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  28.69 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 		 499 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 492 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  28.21 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49570  amino acid permease  28.8 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  28.23 
 
 		 519 aa  156  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 497 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 487 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  29.41 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  25.98 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0940  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 		 504 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  24.06 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 522 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  25.54 
 
 		 526 aa  123  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  22.94 
 
 		 515 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  27.21 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  25.74 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  22.8 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  23.53 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  24.85 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 522 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  29.09 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.94 
 
 		 507 aa  96.7  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  23.53 
 
 		 542 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  27.35 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  28.77 
 
 		 525 aa  93.2  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 454 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  24.88 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 454 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  22.93 
 
 		 571 aa  90.5  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  23.99 
 
 		 764 aa  90.5  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.93 
 
 		 471 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.51 
 
 		 471 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.53 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  25.53 
 
 		 467 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.51 
 
 		 471 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.93 
 
 		 471 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  23.75 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.06 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.42 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.53 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  22.36 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.26 
 
 		 467 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.05 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  27.18 
 
 		 576 aa  87.4  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 440 aa  87  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.37 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.41 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.33 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.05 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.05 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  23.52 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>