101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2578 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  271  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  38.37 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  36.9 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  46.27 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  33.33 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  36.08 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  37.66 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  35.79 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  41.54 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  40.54 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  39.39 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  36.76 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  39.71 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  32.88 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  36.62 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  43.28 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  37.31 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  32.93 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  42.25 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  32 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  28.75 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  32.67 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  36.11 
 
 		 243 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  39.02 
 
 		 238 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 226 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30.21 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  40.3 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  32.63 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  30 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  29.67 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  35.71 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  34.94 
 
 		 216 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  31.58 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 219 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  33.82 
 
 		 270 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  29.79 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  34.57 
 
 		 235 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  40 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  34.85 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  32.53 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  31.08 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 213 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  28.75 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  30 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  28.36 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  26.92 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  36.62 
 
 		 257 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 107 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  34.12 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 262 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  28.85 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  33.78 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  33.85 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  34.72 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  35.21 
 
 		 261 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  29.58 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  27.83 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  30 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  36.11 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  28.32 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 223 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 223 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  25.69 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 200 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  34.57 
 
 		 238 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>