141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3438 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 408 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  94.03 
 
 		 403 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  97.79 
 
 		 403 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  76.57 
 
 		 402 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  71.7 
 
 		 395 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  45.77 
 
 		 407 aa  292  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.55 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.35 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  20.66 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.64 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  30.51 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.5 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  26.88 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  28.65 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.23 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  21.68 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.37 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  32.17 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  25 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.5 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 		 281 aa  53.5  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  20.47 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.8 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  25.38 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  27.2 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  30.77 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  23.04 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  26.14 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.88 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  24.75 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  20 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  25.43 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  35.87 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.85 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.98 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  33.57 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  25.43 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  27.34 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  27.34 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  26.56 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>