50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1070 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  84.91 
 
 		 159 aa  249  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  84.28 
 
 		 159 aa  248  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  84.91 
 
 		 159 aa  247  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  56.6 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  43.95 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  48.75 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  51.28 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  40.36 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  40.49 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  33.12 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  34.38 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  35.58 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  35.8 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  37.27 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  36.48 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  35.88 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  33.96 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  32.21 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  31.06 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  32.93 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  30.77 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  30.67 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  34.17 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  31.61 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  37.11 
 
 		 152 aa  62  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  31.73 
 
 		 253 aa  57.4  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  29.14 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  45.59 
 
 		 633 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.37 
 
 		 580 aa  55.1  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  28.21 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  29.66 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  29.75 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  40.32 
 
 		 626 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  38.89 
 
 		 600 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  40.58 
 
 		 634 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  37.37 
 
 		 566 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1314  PUA domain-containing protein  43.06 
 
 		 546 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.188899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  38.27 
 
 		 615 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  37.35 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  34.78 
 
 		 546 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  35.56 
 
 		 585 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  34.15 
 
 		 582 aa  44.7  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  40.28 
 
 		 608 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  37.14 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1286  PUA domain-containing protein  36.49 
 
 		 544 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000728632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  32.5 
 
 		 590 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  28.07 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>