207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3805 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  100 
 
 
526 aa  1095    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  54.99 
 
 
542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0248  resolvase domain-containing protein  54.47 
 
 
524 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000541084  hitchhiker  0.00459613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  47.5 
 
 
539 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  26.61 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  23.83 
 
 
524 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  24.08 
 
 
743 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.9 
 
 
517 aa  97.8  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  26.88 
 
 
493 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  27.27 
 
 
539 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  23.45 
 
 
525 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.6 
 
 
582 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  22.97 
 
 
549 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.49 
 
 
534 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  25.29 
 
 
540 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  26.36 
 
 
568 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.49 
 
 
534 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.49 
 
 
534 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.01 
 
 
590 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.55 
 
 
445 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  23.02 
 
 
516 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  26.19 
 
 
534 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  29.96 
 
 
525 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.08 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  24.21 
 
 
510 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.19 
 
 
534 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.38 
 
 
551 aa  87.4  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.19 
 
 
537 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  29.6 
 
 
525 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.18 
 
 
561 aa  86.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.61 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  25.89 
 
 
534 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  24.94 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.79 
 
 
537 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.14 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  22.64 
 
 
579 aa  80.9  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  24.65 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  24.24 
 
 
565 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  24.5 
 
 
607 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.57 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.32 
 
 
522 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.22 
 
 
500 aa  76.6  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.53 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  24.83 
 
 
532 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  22.93 
 
 
555 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.34 
 
 
542 aa  74.3  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.15 
 
 
613 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.3 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.34 
 
 
542 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.34 
 
 
542 aa  73.6  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  21.27 
 
 
528 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 
537 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.1 
 
 
521 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  25.97 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.97 
 
 
484 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  24.32 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.44 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  23.72 
 
 
544 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  26.14 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  22.6 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  20.81 
 
 
528 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  23.62 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  23.64 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  24.46 
 
 
665 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.52 
 
 
511 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  22.99 
 
 
545 aa  67  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  23.3 
 
 
441 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0976  resolvase-like protein  51.39 
 
 
72 aa  66.6  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.735809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  24.6 
 
 
460 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.6 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  25.42 
 
 
449 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.33 
 
 
504 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.2 
 
 
529 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  24.55 
 
 
532 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.52 
 
 
459 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  24.68 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  25.07 
 
 
550 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  22.96 
 
 
462 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.79 
 
 
558 aa  64.3  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  24.54 
 
 
441 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.49 
 
 
482 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
555 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  24.85 
 
 
485 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  22.06 
 
 
561 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.36 
 
 
527 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  27.04 
 
 
467 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  27.17 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  25.23 
 
 
443 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  23.43 
 
 
462 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  26.14 
 
 
469 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  23.65 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  26.14 
 
 
469 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  26.14 
 
 
469 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  23.43 
 
 
515 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.03 
 
 
522 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  23.64 
 
 
462 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  21.57 
 
 
535 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  22.62 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  20.9 
 
 
551 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>