213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0271 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  50 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  42.51 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  42.11 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  45.96 
 
 		 255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  47.01 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  44.17 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  46.41 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  44.26 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  43.1 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  43.1 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  41.49 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  42.26 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  42.19 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  39.35 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  39.04 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  31.8 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  30.67 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  32.2 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  32.24 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  32.35 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  34.68 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  33.02 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  29.61 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  33.05 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  28.45 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  32.86 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  32.38 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  32.29 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  32.63 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  31.82 
 
 		 253 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  29.61 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  31.05 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  28.27 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  33.03 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.12 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  27.43 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  26.99 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  26.43 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  29.05 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  25.53 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  28.82 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  28.5 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  26.38 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  29.26 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  25.93 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  24.07 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  25.85 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  26.95 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  26.34 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  24.3 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  26.34 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.38 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  30.47 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  25.88 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  24.79 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  23.58 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  25.23 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  27.9 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  24.55 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  24.55 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  30.93 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  24.31 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  28.19 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  27.75 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  25.96 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  25.62 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  28.96 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  28.7 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  24.24 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  23.19 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  30.05 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  26.67 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  27.75 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  26.09 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  23.98 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.57 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  23.93 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  23.97 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  24.68 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>