68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2043 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  41.73 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.52 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  30.11 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  24.91 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  29.41 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  23.79 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.81 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.16 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  28.16 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  34.66 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  26.86 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27.57 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  26.45 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  26.59 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.47 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.05 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  25.51 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  25.51 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  28.15 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  26.25 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  28.04 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  27.52 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.24 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  30.3 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  33.88 
 
 		 425 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  28.57 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.35 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  33.88 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  23.32 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25 
 
 		 803 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  31.36 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  27.56 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.39 
 
 		 422 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  30.23 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  28.12 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  25.35 
 
 		 353 aa  49.3  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  29.82 
 
 		 301 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  28.43 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  28.12 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  28.12 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  28.12 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  28.12 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  28.12 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  28.12 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  24.63 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  28.95 
 
 		 327 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  30.53 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  29.41 
 
 		 357 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  29.41 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  21.88 
 
 		 243 aa  45.8  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  25 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  30.14 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  29.77 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  25.87 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  27.74 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  30 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  26.55 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  26.04 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  30.39 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  27.69 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  26.98 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  24.41 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  25.74 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  26.45 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>