More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1439 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 605 aa  1236    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.24 
 
 		 606 aa  625  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.42 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.16 
 
 		 881 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.17 
 
 		 647 aa  588  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.4 
 
 		 611 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.23 
 
 		 674 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.11 
 
 		 709 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.09 
 
 		 617 aa  548  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  46.02 
 
 		 611 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.36 
 
 		 611 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 		 609 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 		 609 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.19 
 
 		 611 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  46.02 
 
 		 609 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 		 599 aa  538  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 		 609 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 		 609 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.95 
 
 		 620 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 		 611 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.95 
 
 		 714 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.68 
 
 		 599 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.55 
 
 		 596 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.85 
 
 		 615 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.85 
 
 		 615 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.05 
 
 		 624 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.65 
 
 		 603 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.85 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.85 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.01 
 
 		 607 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.61 
 
 		 611 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 610 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 610 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.69 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.02 
 
 		 609 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.29 
 
 		 625 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.29 
 
 		 607 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.59 
 
 		 597 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.34 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  44.9 
 
 		 615 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  44.87 
 
 		 600 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.04 
 
 		 600 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.97 
 
 		 619 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.87 
 
 		 718 aa  522  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.33 
 
 		 608 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.81 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.25 
 
 		 614 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 		 608 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.89 
 
 		 731 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.48 
 
 		 709 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.51 
 
 		 715 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.35 
 
 		 722 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 		 599 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 601 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.84 
 
 		 612 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.21 
 
 		 601 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.07 
 
 		 707 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.83 
 
 		 615 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.1 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.09 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.67 
 
 		 616 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 		 611 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.86 
 
 		 601 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.21 
 
 		 719 aa  502  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  44.69 
 
 		 601 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 		 709 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 		 607 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.67 
 
 		 625 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 613 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.35 
 
 		 625 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 615 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 615 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 607 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 647 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 658 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 615 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.91 
 
 		 607 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.33 
 
 		 607 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 615 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  44.02 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.17 
 
 		 763 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.05 
 
 		 602 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.71 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.52 
 
 		 717 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.48 
 
 		 611 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.9 
 
 		 610 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.17 
 
 		 736 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 607 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 		 710 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.03 
 
 		 633 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  42.78 
 
 		 608 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.08 
 
 		 644 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.98 
 
 		 603 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.37 
 
 		 619 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 		 612 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 607 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.07 
 
 		 607 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 		 607 aa  492  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>