More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0333 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  77.64 
 
 		 502 aa  816    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  62.38 
 
 		 510 aa  646    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  63.96 
 
 		 510 aa  672    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  72.11 
 
 		 503 aa  780    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  62.57 
 
 		 510 aa  647    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  73.45 
 
 		 503 aa  792    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  73.71 
 
 		 502 aa  784    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  63.37 
 
 		 510 aa  659    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  73.71 
 
 		 503 aa  801    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 505 aa  1041    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  61.39 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  55.76 
 
 		 507 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  56.77 
 
 		 500 aa  565  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  55.76 
 
 		 502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  53.3 
 
 		 530 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  54.95 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  55.15 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  54.14 
 
 		 501 aa  545  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  53.89 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  51.1 
 
 		 500 aa  532  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  50.7 
 
 		 500 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  51.1 
 
 		 500 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  54.55 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  53 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  53 
 
 		 507 aa  530  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  53.58 
 
 		 497 aa  525  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  52.02 
 
 		 509 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  52.42 
 
 		 509 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  52.83 
 
 		 509 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  48.04 
 
 		 747 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  45.45 
 
 		 712 aa  314  1.9999999999999998e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  47.29 
 
 		 741 aa  311  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  44.48 
 
 		 685 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  45.35 
 
 		 681 aa  270  7e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  44.44 
 
 		 693 aa  266  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1101  glutamate synthase (NADPH)  43.14 
 
 		 684 aa  265  2e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.338613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  36.22 
 
 		 529 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  41.03 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  35.57 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  34.32 
 
 		 529 aa  213  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.9 
 
 		 514 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  39.12 
 
 		 1499 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  39.12 
 
 		 1499 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  39.88 
 
 		 466 aa  210  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  38.35 
 
 		 516 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  36.49 
 
 		 1516 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  40.06 
 
 		 1526 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.31 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  37.07 
 
 		 1515 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  36.49 
 
 		 1516 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3121  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.68 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0236823  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.82 
 
 		 1577 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1225  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.33 
 
 		 492 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.51 
 
 		 496 aa  206  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.15 
 
 		 1519 aa  206  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1511 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2985  glutamate synthase (ferredoxin)  37.82 
 
 		 1554 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  38.79 
 
 		 1519 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  34.99 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.65 
 
 		 1510 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  37.04 
 
 		 1583 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 		 1572 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 		 1572 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.25 
 
 		 510 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  35.5 
 
 		 516 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  37.32 
 
 		 1583 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  37.32 
 
 		 1583 aa  203  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3654  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.07 
 
 		 1558 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  40 
 
 		 1512 aa  203  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  38.1 
 
 		 1546 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.21 
 
 		 1525 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.42 
 
 		 1518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.56 
 
 		 1502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.23 
 
 		 1533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0474  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.19 
 
 		 1525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.17 
 
 		 1519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3176  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.18 
 
 		 1546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.42 
 
 		 1518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  39 
 
 		 1489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  39.42 
 
 		 1518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  39.56 
 
 		 1534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  40.89 
 
 		 1502 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  36.21 
 
 		 1530 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.56 
 
 		 1520 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  37.17 
 
 		 1508 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.34 
 
 		 1512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.54 
 
 		 1524 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.39 
 
 		 1483 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  37.58 
 
 		 1584 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0865  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.29 
 
 		 1536 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  37.35 
 
 		 1553 aa  200  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1350  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.54 
 
 		 1527 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000183365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  37.54 
 
 		 1518 aa  199  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.61 
 
 		 1535 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  36.78 
 
 		 1533 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1528 aa  199  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0854  glutamate synthase (ferredoxin)  37.97 
 
 		 1540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265918  normal  0.188488 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0869  Glutamate synthase (ferredoxin)  38.29 
 
 		 1536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.600507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  38.78 
 
 		 1527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  40.51 
 
 		 1564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>