More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0162 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  100 
 
 
214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  72.82 
 
 
219 aa  340  9e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  69.67 
 
 
223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  63.51 
 
 
220 aa  291  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  62.26 
 
 
230 aa  287  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  63.16 
 
 
214 aa  286  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  62.14 
 
 
213 aa  281  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  61.79 
 
 
213 aa  280  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  63.59 
 
 
213 aa  278  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  61.84 
 
 
214 aa  274  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  57.82 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  59.15 
 
 
216 aa  272  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  58.06 
 
 
217 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  60.87 
 
 
241 aa  267  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  57.49 
 
 
215 aa  252  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  57.14 
 
 
221 aa  250  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  52.97 
 
 
229 aa  248  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  52.51 
 
 
226 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  56.34 
 
 
212 aa  240  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  54.93 
 
 
212 aa  236  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  49.55 
 
 
240 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  50 
 
 
228 aa  235  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  55.5 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  52.11 
 
 
215 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  53.49 
 
 
223 aa  229  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  51.64 
 
 
215 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.1 
 
 
213 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.82 
 
 
220 aa  227  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.83 
 
 
215 aa  226  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  53.24 
 
 
226 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  49.77 
 
 
216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.11 
 
 
225 aa  221  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  51.42 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  48.83 
 
 
232 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  51.17 
 
 
215 aa  214  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  50.48 
 
 
213 aa  214  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  49.29 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  45.85 
 
 
234 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  51.94 
 
 
217 aa  211  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  50.23 
 
 
225 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  49.53 
 
 
230 aa  210  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  50.5 
 
 
221 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.42 
 
 
224 aa  208  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  50.5 
 
 
221 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  49.77 
 
 
224 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.06 
 
 
216 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  48.11 
 
 
232 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  47.96 
 
 
224 aa  204  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  49.18 
 
 
208 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  50.71 
 
 
212 aa  203  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  49.55 
 
 
217 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  49.09 
 
 
217 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  49.55 
 
 
217 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  50.45 
 
 
217 aa  201  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  48.34 
 
 
225 aa  201  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  49.76 
 
 
212 aa  201  7e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  48.61 
 
 
215 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  46.85 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  48.18 
 
 
217 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  49.77 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  46.01 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  47.17 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.73 
 
 
212 aa  194  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.73 
 
 
210 aa  194  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.64 
 
 
217 aa  190  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  47.29 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.17 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  44 
 
 
217 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  46.91 
 
 
212 aa  186  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  45.5 
 
 
212 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  48 
 
 
221 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  46 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  45.73 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  45 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  44 
 
 
213 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  44.5 
 
 
212 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  43.72 
 
 
209 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  44.22 
 
 
212 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  48.33 
 
 
217 aa  180  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  42.71 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  43.5 
 
 
212 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  43 
 
 
212 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  43 
 
 
212 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  43.5 
 
 
212 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  43.5 
 
 
212 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  42.5 
 
 
212 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  43.75 
 
 
212 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  43.59 
 
 
208 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  44 
 
 
212 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  43.5 
 
 
213 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  43.2 
 
 
217 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  42.72 
 
 
217 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  43.23 
 
 
212 aa  174  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  43 
 
 
212 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  42.5 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  42.5 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.5 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.5 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.5 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>