More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0061 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  60.45 
 
 		 220 aa  263  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  56.81 
 
 		 225 aa  246  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  51.57 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  45.28 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  44.81 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  44.98 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  46.22 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  44.74 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  44 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  42.04 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  41.96 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  42.73 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  38.86 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  45.75 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  41.48 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  41.92 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  41.05 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  42.36 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  44.55 
 
 		 245 aa  157  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  36.91 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  43.42 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  42.27 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  40.71 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  39.52 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  41.33 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  39.53 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  35.62 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  35.5 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  35.5 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  35.65 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  35.04 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  33.48 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  40.71 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  41.12 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  37.04 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  34.55 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  40.3 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  34.39 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  34.09 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  33.19 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  34.09 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  34.8 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  40.68 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  36.64 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  41.11 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  33.48 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>