More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1071 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 454 aa  906    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  78.34 
 
 		 457 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.05 
 
 		 454 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  65.82 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.08 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  43.32 
 
 		 399 aa  272  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 424 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  36.8 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  38.19 
 
 		 404 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  37.44 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  35.91 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  35.91 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  39.46 
 
 		 502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  37.71 
 
 		 484 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  34.86 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  37.94 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  36.48 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  36.06 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  38.4 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  36.21 
 
 		 489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  35.94 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 416 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  36.41 
 
 		 400 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 538 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 		 489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  36.57 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  35.65 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  36.03 
 
 		 516 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  35.75 
 
 		 489 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  35.75 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  35.75 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  35.75 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  35.47 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  35.75 
 
 		 489 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 416 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  33.87 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  34.15 
 
 		 484 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 421 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  33.88 
 
 		 484 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.07 
 
 		 531 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  36.93 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  34.75 
 
 		 491 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  33.5 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.88 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  32.9 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  32.75 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 		 410 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  31.39 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  31.63 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  31.49 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  31.35 
 
 		 382 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 308 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  38.5 
 
 		 327 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.69 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.19 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  36.68 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  38.69 
 
 		 329 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.87 
 
 		 376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  37.04 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  36.41 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2578  secretion protein HlyD  31.83 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.96147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0905036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  38.31 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  34.67 
 
 		 331 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.7 
 
 		 424 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  29.81 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2147  secretion protein HlyD  29.4 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 460 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  30.45 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 359 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 587 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  28.77 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.81 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11688  cation efflux system protein  26.52 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.600271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08530  efflux system component, RND family  32.58 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  29.91 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  30.65 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  30.35 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  27.92 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>