More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2186 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
915 aa  948    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
892 aa  660    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
914 aa  984    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
892 aa  786    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
910 aa  791    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
913 aa  948    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
892 aa  671    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  69.67 
 
 
923 aa  1380    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 
924 aa  854    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
916 aa  1001    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
926 aa  848    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
923 aa  1914    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
913 aa  1015    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
896 aa  678    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
892 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
899 aa  663    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
882 aa  735    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
913 aa  1129    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
926 aa  843    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
892 aa  786    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
892 aa  786    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
907 aa  647    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
926 aa  887    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 
892 aa  667    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
925 aa  889    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
900 aa  623  1e-177  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 
904 aa  600  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
889 aa  521  1e-146  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  29.24 
 
 
880 aa  325  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 
877 aa  323  7e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
879 aa  313  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
883 aa  303  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
879 aa  302  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 
875 aa  301  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 
876 aa  298  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 
864 aa  296  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
878 aa  296  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
865 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
870 aa  296  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  27.15 
 
 
878 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 
897 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  26.68 
 
 
874 aa  294  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 
874 aa  293  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  26.48 
 
 
897 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
876 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
874 aa  292  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
865 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  26.96 
 
 
869 aa  291  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  27.29 
 
 
868 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
874 aa  289  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
897 aa  288  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 
884 aa  288  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
874 aa  288  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
874 aa  287  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  27.74 
 
 
878 aa  287  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
874 aa  287  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
874 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
872 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
874 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.95 
 
 
878 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
882 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
877 aa  283  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
877 aa  283  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 
879 aa  283  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
874 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
874 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
881 aa  283  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
874 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
874 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
874 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  27.11 
 
 
874 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
874 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
880 aa  281  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
889 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2490  alanyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 
877 aa  281  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000298908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
874 aa  281  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
874 aa  281  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 
863 aa  280  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
904 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 
874 aa  279  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
874 aa  279  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 
874 aa  279  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 
905 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
874 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0936  alanyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
870 aa  279  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
860 aa  278  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
876 aa  278  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
886 aa  277  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
865 aa  277  7e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 
905 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
905 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  24.73 
 
 
860 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 
871 aa  275  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
859 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 
879 aa  273  9e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
886 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
874 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  27.26 
 
 
879 aa  273  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  27.28 
 
 
886 aa  272  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
863 aa  272  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>