More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0233 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  788    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  60.59 
 
 		 372 aa  485  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  59.79 
 
 		 383 aa  473  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  59.09 
 
 		 372 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  55.23 
 
 		 367 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  34.57 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 		 356 aa  219  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 356 aa  201  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 461 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.37 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  25.71 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  25.38 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 351 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.29 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.78 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.43 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.96 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  27.32 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.02 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  32.84 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  25.12 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  25.36 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.75 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 476 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.57 
 
 		 446 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  23.39 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.19 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.32 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3594  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3584  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3363  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.589823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3627  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3677  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.89 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1640  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 495 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 446 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  20 
 
 		 453 aa  53.5  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>