More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2291 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  749    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  38.36 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  34.02 
 
 		 489 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  33.23 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 		 493 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  27.44 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  26.27 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  27.51 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  28.62 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.69 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  38 
 
 		 168 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.98 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.73 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  32.02 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.67 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  28.94 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  37.27 
 
 		 152 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  40.5 
 
 		 971 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  27.44 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  32.69 
 
 		 745 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 		 525 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  36.75 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.65 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  36.8 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.52 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  34.51 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 		 145 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 		 145 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 576 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  24.39 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.84 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.29 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  32.67 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  32.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.11 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.85 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 973 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  36.26 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  36.45 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  34.19 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  34.91 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.62 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  31.65 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  31.16 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.39 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.8 
 
 		 521 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  29.52 
 
 		 776 aa  57  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.43 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  34.86 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  34.86 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3924  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  33.91 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  34.26 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  33.83 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1861  hypothetical protein  28.75 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.35 
 
 		 174 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 		 517 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 179 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  37.08 
 
 		 168 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.75 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.75 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  28.5 
 
 		 240 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.92 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 		 175 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  33.61 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>