More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0186 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0186  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.715904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.17 
 
 
233 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.87 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.67 
 
 
216 aa  92.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.77 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0454  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
227 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0157661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.22 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.07 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.09 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.86 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.34 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.36 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  33.33 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  33.33 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.88 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 
208 aa  72  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.58 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.52 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.83 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.83 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.83 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.17 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.34 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.76 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3974  biopolymer transport exbB protein  29.47 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  39.81 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.23 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.52 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.97 
 
 
207 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  30.46 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.68 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.9 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  38.33 
 
 
465 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.62 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0608  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.69 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00236146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.19 
 
 
204 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.4 
 
 
403 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  46.25 
 
 
453 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  28.36 
 
 
460 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.25 
 
 
453 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.83 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.71 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  34.43 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.27 
 
 
279 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.71 
 
 
470 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 
208 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
218 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  46.75 
 
 
454 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.16 
 
 
478 aa  62.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.81 
 
 
576 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  43.02 
 
 
228 aa  62.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  33.07 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.79 
 
 
224 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
469 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1853  biopolymer transport exbB protein  32.34 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.86 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
201 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
210 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.52 
 
 
469 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.24 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  28.46 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  42.11 
 
 
474 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  28.95 
 
 
455 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.03 
 
 
488 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.06 
 
 
192 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2625  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.71 
 
 
451 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00264646  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.33 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.55 
 
 
211 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  43.68 
 
 
464 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.03 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.06 
 
 
449 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.57 
 
 
200 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  30.21 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 
218 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  31.64 
 
 
451 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  44.87 
 
 
453 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.38 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
224 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.15 
 
 
457 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  47.3 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.48 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2424  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.98 
 
 
450 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00633842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>