More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0849 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  70.62 
 
 		 514 aa  759    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 514 aa  1028    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  69.98 
 
 		 514 aa  763    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  70.96 
 
 		 514 aa  770    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  71.15 
 
 		 514 aa  772    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  52.61 
 
 		 502 aa  525  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  49.8 
 
 		 485 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  50 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  49.19 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  49.09 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  48.79 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  48.38 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  48.38 
 
 		 492 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0675  (R)-citramalate synthase  47.48 
 
 		 492 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  46.26 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  50.22 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  46.86 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.17 
 
 		 504 aa  451  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0217  (R)-citramalate synthase  47.02 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.172429  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.62 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  46.33 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  49.89 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  46.11 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  48.01 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1442  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.36 
 
 		 496 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323978  hitchhiker  0.00218573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  47.53 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  44.01 
 
 		 525 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  44.84 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  46.22 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  46.05 
 
 		 521 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  46.92 
 
 		 516 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  45.54 
 
 		 505 aa  415  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  46.25 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  45.35 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  45.15 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  45.24 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  44.77 
 
 		 514 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  45.62 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  45.54 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0107  2-isopropylmalate synthase  48.23 
 
 		 505 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.590436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  44.93 
 
 		 499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  46.44 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  44.79 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  44.82 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0596  2-isopropylmalate synthase  42.29 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  45.92 
 
 		 516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  43.87 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  44.66 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  44.47 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  44.42 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0476  pyruvate carboxyltransferase  40.96 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  43.39 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  43.98 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  44.93 
 
 		 516 aa  402  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2489  pyruvate carboxyltransferase  41.54 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  43.7 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1485  2-isopropylmalate synthase  44.05 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.221108 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  43.5 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  43.76 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 505 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  42.46 
 
 		 522 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  42.91 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  44.16 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  42.47 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3235  2-isopropylmalate synthase  42.89 
 
 		 521 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.134931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  44.17 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1576  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 527 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.725891  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  44.17 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  44.17 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  41.99 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  42.21 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  43.68 
 
 		 541 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  43.76 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  43.2 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  44.42 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  42.35 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  44.82 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  42.43 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  42.58 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  42.04 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  42.72 
 
 		 529 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  42.83 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  42.52 
 
 		 529 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0025  (R)-citramalate synthase  40.95 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  44.07 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  41.67 
 
 		 523 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  42.52 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  43.54 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0690  2-isopropylmalate synthase  43.31 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  42.64 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  43.79 
 
 		 515 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  44.06 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0534  2-isopropylmalate synthase  42.38 
 
 		 524 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  41.47 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0588  (R)-citramalate synthase  40.08 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404702  normal  0.8161 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  43.59 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2259  2-isopropylmalate synthase  41.5 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.044795  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2428  (R)-citramalate synthase  40.16 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0810846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  42.16 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>