More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5290 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  88.35 
 
 		 601 aa  1022    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 662 aa  1305    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  61.51 
 
 		 571 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  57.97 
 
 		 583 aa  624  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  58.86 
 
 		 583 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  58.45 
 
 		 583 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 		 346 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.13 
 
 		 872 aa  242  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  56.94 
 
 		 346 aa  238  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 		 344 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 586 aa  234  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 897 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 907 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  55.98 
 
 		 575 aa  229  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  48.69 
 
 		 336 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 		 336 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 		 336 aa  220  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 1001 aa  220  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  53.55 
 
 		 326 aa  218  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  31.02 
 
 		 1041 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 1016 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 1002 aa  213  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 465 aa  208  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 850 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 929 aa  197  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 840 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 582 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 372 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 725 aa  188  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 390 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  36.97 
 
 		 499 aa  183  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  34.82 
 
 		 728 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.23 
 
 		 488 aa  177  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 488 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 416 aa  177  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 728 aa  177  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  46.63 
 
 		 384 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 713 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 733 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 389 aa  173  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 481 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 1191 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 488 aa  172  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 409 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 500 aa  170  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  30.28 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  31.28 
 
 		 1202 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.9 
 
 		 1167 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  38.79 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.87 
 
 		 1160 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 460 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 639 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3416  signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 413 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813211  normal  0.0120926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 356 aa  160  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 352 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  41.55 
 
 		 1190 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  39.29 
 
 		 478 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  42.44 
 
 		 364 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 602 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  40.97 
 
 		 930 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 934 aa  153  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 349 aa  153  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 341 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 512 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 555 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 930 aa  151  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 677 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 387 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 577 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 588 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.22 
 
 		 1027 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  39.52 
 
 		 480 aa  147  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  39.02 
 
 		 842 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 488 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  39.42 
 
 		 483 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  42.03 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  32.07 
 
 		 692 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 333 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  34.29 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  39.62 
 
 		 1170 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  39.62 
 
 		 1170 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  38.89 
 
 		 561 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 338 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  33.02 
 
 		 463 aa  144  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  33.02 
 
 		 463 aa  144  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 446 aa  144  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0180  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 380 aa  143  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.012775  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  36.49 
 
 		 1092 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>