More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2720 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  41.94 
 
 		 904 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  41.31 
 
 		 904 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  85.59 
 
 		 943 aa  1504    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.76 
 
 		 904 aa  707    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  100 
 
 		 962 aa  1893    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  43.29 
 
 		 903 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  51.29 
 
 		 882 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.18 
 
 		 906 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  30.72 
 
 		 1043 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 		 887 aa  334  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 1017 aa  332  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  27.09 
 
 		 831 aa  284  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  26.8 
 
 		 834 aa  271  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  24.36 
 
 		 828 aa  257  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  35.85 
 
 		 867 aa  240  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  36.58 
 
 		 869 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  35.1 
 
 		 861 aa  240  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  36.4 
 
 		 867 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  23.56 
 
 		 833 aa  234  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  37.11 
 
 		 901 aa  221  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  35.64 
 
 		 901 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2552  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.88 
 
 		 429 aa  134  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263362  normal  0.0193136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6102  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  24.54 
 
 		 357 aa  103  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  25.12 
 
 		 611 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  26.88 
 
 		 613 aa  94.7  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  20.89 
 
 		 580 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8076  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.58 
 
 		 366 aa  91.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419545  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1097  ABC transporter related  25.4 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0983  ABC transporter, ATP-binding protein, MsbA family  25.4 
 
 		 562 aa  86.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  23.5 
 
 		 617 aa  83.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  24.76 
 
 		 611 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  24.52 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.16 
 
 		 1018 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  25.83 
 
 		 980 aa  79  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  23.88 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  27.4 
 
 		 975 aa  78.2  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  23.88 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  23.88 
 
 		 618 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  22.44 
 
 		 1040 aa  78.2  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  23.66 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  20.78 
 
 		 571 aa  77.4  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.38 
 
 		 1000 aa  77.4  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  24.72 
 
 		 637 aa  77.4  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.1 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  20.43 
 
 		 727 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  23.17 
 
 		 610 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  23.17 
 
 		 610 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.88 
 
 		 572 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  23.17 
 
 		 610 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  18.73 
 
 		 586 aa  76.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  23.68 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  19.9 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  23.92 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  20.23 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.2 
 
 		 1006 aa  74.3  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.96 
 
 		 594 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  22.57 
 
 		 580 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  24.23 
 
 		 976 aa  73.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  20.94 
 
 		 982 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.61 
 
 		 1024 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  20.24 
 
 		 586 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.72 
 
 		 601 aa  73.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  19.85 
 
 		 586 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  19.36 
 
 		 586 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  23.02 
 
 		 725 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.86 
 
 		 717 aa  72.8  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  23.62 
 
 		 584 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.95 
 
 		 571 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  25.4 
 
 		 738 aa  72  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  20.81 
 
 		 1018 aa  72  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  20.54 
 
 		 1018 aa  72  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  25.82 
 
 		 581 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  23.06 
 
 		 580 aa  71.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.96 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  26.38 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  22.64 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  22.64 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.64 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  19.29 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25.52 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.64 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.73 
 
 		 606 aa  71.2  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  23.24 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  20.1 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  20.1 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  19.58 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  20.2 
 
 		 582 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  20.1 
 
 		 586 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  20.09 
 
 		 586 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.12 
 
 		 597 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  22.33 
 
 		 639 aa  70.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.1 
 
 		 586 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.1 
 
 		 586 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.83 
 
 		 1257 aa  70.1  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1304  ABC transporter related  23.72 
 
 		 602 aa  70.1  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  18.93 
 
 		 574 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  25.4 
 
 		 767 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  19.9 
 
 		 586 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  23.61 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  21.47 
 
 		 585 aa  69.7  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>