298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1487 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 434 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  69.72 
 
 		 435 aa  584  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  38.04 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  44.88 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  40.4 
 
 		 518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  38.34 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  32.23 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  32.23 
 
 		 418 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 		 434 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  33.8 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.53 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  32.13 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  32.51 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  32.26 
 
 		 424 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  33.01 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  33.09 
 
 		 671 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.4 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.45 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 		 373 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.15 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.95 
 
 		 365 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.36 
 
 		 501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  29.72 
 
 		 652 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  31.38 
 
 		 657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 337 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  27.23 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.6 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 438 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  24.94 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.83 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  25.64 
 
 		 689 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 		 698 aa  106  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 686 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  36.26 
 
 		 283 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  23.4 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.18 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00245  site-specific DNA-methyltransferase  47.37 
 
 		 735 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.191981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.48 
 
 		 375 aa  103  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  24.24 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  38.8 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.96 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  36.41 
 
 		 342 aa  100  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  34.41 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.21 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  24.13 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  35.33 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.81 
 
 		 313 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  36.08 
 
 		 492 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 		 465 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  28.12 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.22 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0401  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.35 
 
 		 520 aa  93.2  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.428624  hitchhiker  0.000124126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.34 
 
 		 405 aa  92.8  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.29 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  36.02 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  34.83 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  34.67 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  34.07 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 		 508 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  26.59 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.07 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00287  probable C-5 cytosine-specific DNA methylase  52.75 
 
 		 113 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  32.97 
 
 		 308 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  24.69 
 
 		 335 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 		 632 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  33.87 
 
 		 310 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  26.33 
 
 		 352 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.62 
 
 		 236 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 		 313 aa  87  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 320 aa  87  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  25.99 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 		 313 aa  86.7  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  24.82 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  24.75 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  26.88 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  25.29 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  34.02 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>