134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3086 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.34 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.68 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.58 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  30.99 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.14 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  31.73 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.26 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.56 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  32.88 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.02 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.16 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.59 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.54 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.47 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.49 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  33.49 
 
 		 266 aa  72  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  31.78 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.91 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  26.48 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  29.39 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.19 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.67 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.6 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  28.98 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  32.31 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  30.29 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  26.6 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  29.15 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  31.1 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  28.63 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  27.31 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  29.7 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.41 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  30.07 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.28 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.69 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  23.33 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.19 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  26.29 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.86 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.88 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  29.86 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.49 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.29 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  24.54 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  36 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  22.69 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  30.93 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  30.46 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  27.54 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  35.2 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  29.73 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  35.14 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  25.91 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.5 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  27.94 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.75 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  32.8 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  31.43 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.75 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.39 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  29.09 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  24.9 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  24 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  29.85 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  27.15 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  32.58 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  22.52 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  32.58 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  27.12 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  28.32 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  28.44 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.75 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  30.73 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  27.8 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.42 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.95 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  27.76 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  24.27 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.31 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  25.79 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  32.12 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  27.17 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  28.16 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>