More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2746 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2746  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1873  response regulator receiver protein  57.76 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0738  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1281  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000906166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 232 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 		 225 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 227 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 234 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 236 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 234 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 244 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 239 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  46.85 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  46.85 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 250 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  46.85 
 
 		 238 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 239 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 229 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 236 aa  98.2  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  42.61 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 230 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 237 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 231 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 123 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 236 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 226 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 238 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 229 aa  97.1  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 226 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 227 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0627  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00307044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 241 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  43.9 
 
 		 230 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 278 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 233 aa  94.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 226 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 242 aa  94.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.35 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  45.95 
 
 		 239 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 238 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 239 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 241 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 239 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 231 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.95 
 
 		 234 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 224 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 231 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 231 aa  93.6  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 231 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  40.68 
 
 		 229 aa  94  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 225 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 234 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 234 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 235 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 246 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 226 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 228 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 237 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 226 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 237 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 231 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 230 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 229 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4325  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 229 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  43.22 
 
 		 230 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 239 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0246  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 225 aa  92  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0272164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 231 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 236 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>