More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0048 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  36.16 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  33.5 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  37.22 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 188 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  37.67 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  38.16 
 
 		 291 aa  98.6  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 194 aa  98.2  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  38.73 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  34.83 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  41.22 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  33.87 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  31.65 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  31.65 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  37.72 
 
 		 228 aa  92  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  32.28 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  34.09 
 
 		 197 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  31.85 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  31.85 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  31.85 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  31.85 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  31.85 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  31.85 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  33.74 
 
 		 296 aa  85.5  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  34.31 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.61 
 
 		 444 aa  85.1  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 		 363 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  35.56 
 
 		 626 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  36.59 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  37.65 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  41.12 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.82 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  41.12 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  39.25 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  39.25 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  38.74 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.91 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  33.67 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  38.57 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  31.94 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  29.79 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  34.4 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  34.4 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  27.59 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.31 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1595  electron transport protein SCO1/SenC  26.14 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000402998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.74 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.22 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.52 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.94 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  36.7 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  32.35 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  35.77 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  35.59 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  32.65 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03980  YpmQ  31.45 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  32.06 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  34.06 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  28.65 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  25.73 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.25 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  42.39 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
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