295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 156 aa  301  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  77.63 
 
 		 173 aa  236  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  57.76 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2867  lipoprotein signal peptidase  53.95 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3857  lipoprotein signal peptidase  49.62 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0363332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2655  lipoprotein signal peptidase  48.51 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  42.75 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4429  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4578  peptidase A8 signal peptidase II  43.17 
 
 		 182 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  34.88 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  35.04 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  35.05 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.86 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0255  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385605  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 160 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  37 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  39.25 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.69 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  30.52 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.05 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  35.16 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  30.16 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  33.66 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  41.67 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  30 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  38.94 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  36.27 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1210  peptidase A8 signal peptidase II  33.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  31.47 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  29.68 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1185  lipoprotein signal peptidase  31.29 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  27.86 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.58 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  31.25 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  36.27 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3519  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  30.67 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  29.37 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  34.92 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  28.31 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  37.39 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  29.29 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  28.91 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  29.51 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0735  lipoprotein signal peptidase  26.28 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.81 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  35.35 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  25.74 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  30.58 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  28.17 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1095  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.120995  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  34.19 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 272 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1155  lipoprotein signal peptidase II  38.33 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0136608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  33.56 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4118  peptidase A8 signal peptidase II  37.69 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.13 
 
 		 202 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  34.58 
 
 		 224 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>