More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  100 
 
 		 291 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  46.02 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  46.02 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  43.42 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  45.14 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  45.2 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  43.11 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  45.58 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 441 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  39.93 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.58 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  41.58 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  41.58 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  41.79 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  39.5 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 		 368 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45.94 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 		 484 aa  175  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  42.61 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  41.11 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.75 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  43.25 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  39.65 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  40.35 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  33.55 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  50.67 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.33 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  43.94 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  43.85 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  34.06 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  36.64 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 		 285 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  35.27 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 271 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  43.59 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.27 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.27 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.39 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.27 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.27 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.27 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 318 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  36.15 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  33.64 
 
 		 272 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.06 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>