More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  63.4 
 
 		 651 aa  734    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 		 662 aa  1329    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  63.55 
 
 		 639 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  50.23 
 
 		 678 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  51.32 
 
 		 663 aa  610  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  44.93 
 
 		 664 aa  529  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  47.64 
 
 		 573 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  47.05 
 
 		 583 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  48.37 
 
 		 573 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  45.87 
 
 		 671 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  47.52 
 
 		 582 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  47.52 
 
 		 582 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  47.52 
 
 		 582 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  50.55 
 
 		 610 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  48.19 
 
 		 611 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  45.6 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  44.12 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  44.3 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  43.44 
 
 		 582 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  42.75 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  47.21 
 
 		 592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  46.53 
 
 		 602 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  42.29 
 
 		 629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  44.27 
 
 		 580 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  41.85 
 
 		 694 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  41.67 
 
 		 602 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  45.32 
 
 		 586 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  41.37 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  37.63 
 
 		 600 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  42.32 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  43.76 
 
 		 574 aa  350  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  40.14 
 
 		 580 aa  349  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  40.43 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  40.24 
 
 		 606 aa  347  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0292  BCCT transporter  46.19 
 
 		 513 aa  346  8e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  39.15 
 
 		 637 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  43.89 
 
 		 525 aa  343  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  36.9 
 
 		 573 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  35.66 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  38.07 
 
 		 503 aa  327  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  35.24 
 
 		 516 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  36.36 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  36.36 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  39.55 
 
 		 549 aa  322  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  36.36 
 
 		 516 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  36.17 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  36.17 
 
 		 516 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  36.17 
 
 		 516 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  35.81 
 
 		 516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  35.97 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  36.17 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  38.63 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  38.23 
 
 		 520 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  38.23 
 
 		 520 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  38.02 
 
 		 498 aa  312  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  37.95 
 
 		 546 aa  312  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  37.74 
 
 		 534 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  37.18 
 
 		 540 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  38.35 
 
 		 698 aa  310  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  41.96 
 
 		 593 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  36.23 
 
 		 603 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  37.2 
 
 		 551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  37.4 
 
 		 508 aa  306  6e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  37.84 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  37.84 
 
 		 548 aa  306  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  38.89 
 
 		 497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  36.59 
 
 		 504 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 504 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  38.79 
 
 		 676 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  36.87 
 
 		 642 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  39.01 
 
 		 676 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  35.24 
 
 		 494 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  36.33 
 
 		 505 aa  303  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  36.33 
 
 		 505 aa  303  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  39.01 
 
 		 691 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  35.81 
 
 		 505 aa  303  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  35.81 
 
 		 505 aa  303  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  36.01 
 
 		 504 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  37.72 
 
 		 676 aa  303  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  35.81 
 
 		 505 aa  303  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  36.5 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  36.13 
 
 		 505 aa  302  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  35.62 
 
 		 505 aa  301  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  33.01 
 
 		 657 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 523 aa  300  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  37.41 
 
 		 550 aa  299  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  36.17 
 
 		 526 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  38.15 
 
 		 673 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  37.62 
 
 		 526 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  38.15 
 
 		 676 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  38.15 
 
 		 676 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  38.15 
 
 		 716 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  38.15 
 
 		 716 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  38.15 
 
 		 676 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  38.15 
 
 		 676 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  38.15 
 
 		 676 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  35.67 
 
 		 567 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  38.02 
 
 		 667 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  35.26 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  38.79 
 
 		 676 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>