More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3499 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 497 aa  1002    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 475 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2089  glycosyl transferase family 2  35.28 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0985  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 482 aa  243  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  hitchhiker  0.00119227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3497  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01470  glycosyl transferase  33.26 
 
 		 481 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 523 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  24.44 
 
 		 365 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.28 
 
 		 1099 aa  83.6  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.14 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29 
 
 		 752 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.03 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  25.37 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  24.64 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 1120 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  32.73 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 772 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.01 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.13 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 1154 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.66 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.48 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  26.02 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.48 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 235 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  26.02 
 
 		 421 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 789 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 789 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 789 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  22.89 
 
 		 1002 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.34 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  23.69 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  27.34 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  23.67 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 844 aa  63.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  23.67 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  23.67 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  23.67 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  23.67 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  23.67 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  27.15 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  22.04 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.44 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5398  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.298595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.4 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1390  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 889 aa  60.5  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  26 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.7 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.93 
 
 		 694 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  24.56 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  21.63 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  25.62 
 
 		 869 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 1101 aa  58.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  39.51 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 		 831 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 1124 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 		 415 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.4 
 
 		 479 aa  57  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 428 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  23.9 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.81 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 		 919 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1075  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>