158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2937 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  100 
 
 		 448 aa  862    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.83 
 
 		 496 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  30.57 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  29.44 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  27.88 
 
 		 519 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.86 
 
 		 480 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  27.33 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  29.36 
 
 		 507 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  28.69 
 
 		 512 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  29.82 
 
 		 516 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.88 
 
 		 498 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  27.86 
 
 		 520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  29.19 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 539 aa  133  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.98 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  22.74 
 
 		 472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  24.6 
 
 		 549 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  28.07 
 
 		 511 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  30.16 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  23.14 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.19 
 
 		 1033 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  24.95 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.64 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.48 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.58 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  27.03 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  27.87 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  21.62 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  28.73 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  28.73 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  28.73 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  29.51 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  33.33 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  42.67 
 
 		 519 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  26.39 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.29 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  26.67 
 
 		 497 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.06 
 
 		 545 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4557  hypothetical protein  25.09 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  52.17 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  39.73 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.85 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  25.82 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  43.48 
 
 		 498 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  32.73 
 
 		 472 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.81 
 
 		 469 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  55.32 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.15 
 
 		 454 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  55.32 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  55.32 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  55.32 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  27.81 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.6 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3657  glutamate synthase subunit beta  55.32 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  55.32 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  42.42 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  30.48 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  56.52 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  50.91 
 
 		 525 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  53.19 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  46.3 
 
 		 556 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3749  glutamate synthase subunit beta  48.94 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  24.06 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  21.92 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  46.38 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  27.62 
 
 		 369 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  54 
 
 		 519 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  20.65 
 
 		 525 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  53.19 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2530  UDP-galactopyranose mutase  27.47 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0566  glutamate synthase subunit beta  59.52 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  24.58 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  53.19 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  43.33 
 
 		 1293 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  51.92 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  50.98 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  51.06 
 
 		 658 aa  46.6  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1873  glutamate synthase subunit beta  52.5 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0835  glutamate synthase subunit beta  51.06 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.387522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  45.76 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  42.25 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>