68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  100 
 
 
461 aa  916    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  72.05 
 
 
468 aa  653    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  72.37 
 
 
468 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  69.7 
 
 
469 aa  623  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  64.52 
 
 
476 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  59.7 
 
 
497 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  59.05 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  57.92 
 
 
759 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  56.68 
 
 
461 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  56.28 
 
 
764 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  56.49 
 
 
453 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  55.88 
 
 
453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  54.57 
 
 
446 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  54.69 
 
 
445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  59.29 
 
 
424 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  51.71 
 
 
442 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  53.77 
 
 
471 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  50.24 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  50.82 
 
 
434 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  53.65 
 
 
451 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  53.15 
 
 
445 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  52.1 
 
 
497 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 
405 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  49.41 
 
 
454 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  48.4 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.12 
 
 
377 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.29 
 
 
330 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.82 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  27.78 
 
 
363 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 
362 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.56 
 
 
527 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.28 
 
 
361 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.6 
 
 
335 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.44 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.06 
 
 
362 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.83 
 
 
348 aa  50.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.13 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.3 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  21.56 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.56 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.56 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  21.56 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  21.56 
 
 
326 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  39.29 
 
 
480 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.73 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.56 
 
 
326 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.87 
 
 
326 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.54 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  21.13 
 
 
327 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.11 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.32 
 
 
326 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  45.65 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 
513 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  45.65 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  38.89 
 
 
496 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.19 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.48 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  26.83 
 
 
524 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  25.32 
 
 
360 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  24.02 
 
 
320 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  24.02 
 
 
320 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.56 
 
 
552 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  25 
 
 
362 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>