73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0215 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
461 aa  910    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  61.08 
 
 
453 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  60.99 
 
 
446 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  61.45 
 
 
445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  57.75 
 
 
468 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  57.48 
 
 
494 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  57.6 
 
 
469 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  57.88 
 
 
468 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  60.92 
 
 
497 aa  487  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  59.31 
 
 
476 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  56.68 
 
 
461 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  55.9 
 
 
759 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  55 
 
 
764 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  56.43 
 
 
445 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  51.01 
 
 
456 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  54.28 
 
 
453 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  59.9 
 
 
424 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  55.63 
 
 
451 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  52.6 
 
 
442 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  56.42 
 
 
405 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.83 
 
 
434 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  50.89 
 
 
454 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  51.24 
 
 
471 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  51.36 
 
 
497 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  51.48 
 
 
441 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.76 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.87 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  23.97 
 
 
327 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.22 
 
 
361 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  22.88 
 
 
326 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.94 
 
 
326 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  23.95 
 
 
330 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.5 
 
 
536 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.32 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.37 
 
 
335 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.94 
 
 
326 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.67 
 
 
326 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  21.67 
 
 
326 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.67 
 
 
326 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.77 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.01 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  21.67 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0176  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 
569 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  20.74 
 
 
326 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  20.74 
 
 
326 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.81 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.82 
 
 
330 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  26.92 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.21 
 
 
422 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.7 
 
 
516 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  23.53 
 
 
884 aa  47.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.11 
 
 
331 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0192  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.93 
 
 
418 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.592255  normal  0.171794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.6 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.86 
 
 
326 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1170  nitrite reductase [NAD(P)H], large subunit  30.86 
 
 
902 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0141525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0063  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.38 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.59 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.69 
 
 
527 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1052  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.21 
 
 
571 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0869882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4268  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.26 
 
 
527 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.32 
 
 
334 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0783  nitric oxide reductase  27 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.21 
 
 
377 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  59.46 
 
 
519 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  24.85 
 
 
524 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.75 
 
 
348 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 
513 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5659  nitrite reductase (NAD(P)H), large subunit  29.17 
 
 
854 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.150409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>