53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1915 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  100 
 
 		 451 aa  876    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  74.37 
 
 		 445 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  59.5 
 
 		 759 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  59.57 
 
 		 764 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  55.63 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  55.84 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  55.8 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  55.75 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  54.82 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  57.93 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  56.38 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  57.42 
 
 		 494 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  54.81 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  54.53 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  56.94 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  54.27 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  54.89 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  55.99 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.95 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  49.25 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.65 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  53.79 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  53.49 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  50.12 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  31.94 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.72 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 642 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 642 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.76 
 
 		 361 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  25.58 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.08 
 
 		 362 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.8 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  27.11 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4019  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.91 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  32.56 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.86 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.47 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.95 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.11 
 
 		 663 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.17 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.03 
 
 		 361 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  31.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.78 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.78 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.65 
 
 		 554 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.35 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.87 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931293  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.08 
 
 		 548 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000799115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.93 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  41.18 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  41.18 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  41.18 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>