93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3968 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  100 
 
 
471 aa  927    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  53.95 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  56.74 
 
 
497 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  56.39 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  56.74 
 
 
468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  56.74 
 
 
468 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  56.24 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  56.64 
 
 
451 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  54.71 
 
 
759 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  57.24 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  54.82 
 
 
434 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  56.02 
 
 
469 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.51 
 
 
446 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  55.9 
 
 
453 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  50.62 
 
 
764 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 
461 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  52.73 
 
 
445 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.77 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
424 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  55.26 
 
 
476 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 
453 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  54.27 
 
 
454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  54.02 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 
497 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  51.57 
 
 
405 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.44 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.44 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  24.42 
 
 
327 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 
326 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.34 
 
 
329 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 
326 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.57 
 
 
326 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.74 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.04 
 
 
326 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.42 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.52 
 
 
331 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  26.42 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  26.42 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.81 
 
 
364 aa  60.1  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.94 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.94 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  27.13 
 
 
480 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
642 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
642 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.53 
 
 
322 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  24.62 
 
 
330 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3374  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.36 
 
 
335 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  21.52 
 
 
446 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3826  dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)  25.49 
 
 
638 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.45 
 
 
516 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  26.13 
 
 
552 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.27 
 
 
330 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  27.31 
 
 
491 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  21.52 
 
 
446 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
378 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  26.84 
 
 
455 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07228  flavin-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17490)  25.89 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.25292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
382 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1699  putative flavin-binding monooxygenase  27.06 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.12 
 
 
527 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.16 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
382 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  26.91 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.49 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.57 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
363 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.49 
 
 
358 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  23.94 
 
 
558 aa  47.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1839  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
528 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.17 
 
 
326 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  27.65 
 
 
432 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1519  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
483 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.91 
 
 
745 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  28.7 
 
 
489 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.18 
 
 
361 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  27.88 
 
 
360 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3273  flavin-containing monooxygenase FMO  29.19 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.304511  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  27.2 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03248  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 
514 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  29.63 
 
 
661 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.91 
 
 
748 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.44 
 
 
748 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2331  HI0933-like protein protein  25.25 
 
 
338 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10575  monooxygenase  25.23 
 
 
486 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.66 
 
 
335 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  27.79 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  24.42 
 
 
641 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  29.58 
 
 
540 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  25.83 
 
 
671 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.96 
 
 
529 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>