45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0518 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  100 
 
 
445 aa  854    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  74.71 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  56.43 
 
 
461 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  59.17 
 
 
759 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  59.62 
 
 
764 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  58.09 
 
 
469 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  57.21 
 
 
497 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  57.24 
 
 
471 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  55.43 
 
 
494 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  55.04 
 
 
453 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  55.63 
 
 
446 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  57.88 
 
 
476 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  56.06 
 
 
468 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  55.53 
 
 
445 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  58.81 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  55.81 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  54.48 
 
 
442 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 
453 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  52.52 
 
 
434 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  51.69 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  53.92 
 
 
454 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  52.68 
 
 
497 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  53.15 
 
 
461 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 
405 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  49.32 
 
 
441 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  28.84 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26 
 
 
330 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.38 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.71 
 
 
748 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.39 
 
 
745 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.08 
 
 
748 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  25.53 
 
 
480 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1541  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
642 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.394648  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1518  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 
642 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.71 
 
 
663 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.83 
 
 
361 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.85 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  29.02 
 
 
360 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.66 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.68 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  27.19 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1383  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.05 
 
 
673 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.74 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.23 
 
 
329 aa  43.5  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0250  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
422 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>