45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5388 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  75.35 
 
 
494 aa  717    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  993    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  63.87 
 
 
468 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  65.1 
 
 
468 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  63.22 
 
 
476 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  62.23 
 
 
469 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  59.13 
 
 
759 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  58.15 
 
 
461 aa  501  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  60.47 
 
 
461 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  57 
 
 
764 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  56.85 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  54.36 
 
 
453 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  61.37 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  59.72 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  57.01 
 
 
471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  55.72 
 
 
453 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  53.48 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  57.21 
 
 
445 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  52.39 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  52.62 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 
405 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.38 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  53.25 
 
 
454 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 
497 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  49.66 
 
 
441 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  30.28 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.68 
 
 
527 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.72 
 
 
358 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.4 
 
 
361 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.87 
 
 
516 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  49.23 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.4 
 
 
536 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.85 
 
 
335 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  45.28 
 
 
480 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.85 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.47 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.47 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.96 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.04 
 
 
378 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2381  oxidoreductase  27.03 
 
 
374 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  26.1 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.94 
 
 
369 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  41.38 
 
 
496 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.55 
 
 
362 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.24 
 
 
363 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>