67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3656 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  72.05 
 
 
461 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  77.56 
 
 
469 aa  694    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
468 aa  914    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  90.81 
 
 
468 aa  832    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  67.82 
 
 
476 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  64.29 
 
 
497 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  63.5 
 
 
494 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  57.88 
 
 
461 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  60 
 
 
759 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  58.65 
 
 
446 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  59.56 
 
 
764 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  59.48 
 
 
453 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  59.59 
 
 
445 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  60.66 
 
 
453 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  63.07 
 
 
424 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  55.5 
 
 
442 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  56.74 
 
 
471 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  56.38 
 
 
451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.95 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  50.59 
 
 
456 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  56.06 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
497 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  52.16 
 
 
441 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
405 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  49.77 
 
 
454 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.77 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.5 
 
 
335 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.11 
 
 
363 aa  56.6  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  29 
 
 
360 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.57 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.62 
 
 
326 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25 
 
 
326 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.37 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.22 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.43 
 
 
377 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.61 
 
 
527 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.24 
 
 
326 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.24 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.6 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.18 
 
 
326 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.17 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  24.17 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  24.17 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.59 
 
 
372 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  28.12 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  20.56 
 
 
462 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4268  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.3 
 
 
527 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  22.46 
 
 
327 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  20.94 
 
 
326 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  20.94 
 
 
326 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.07 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  41.82 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.46 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.4 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.14 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.84 
 
 
858 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.33 
 
 
536 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0726  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  34.82 
 
 
558 aa  45.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3601  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
513 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
528 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1839  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.62 
 
 
528 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.05 
 
 
399 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5581  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.34 
 
 
381 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0864105  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5289  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.34 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655733  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5201  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.34 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2100  FAD dependent oxidoreductase TIGR03364  55.81 
 
 
367 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>