64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5580 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  100 
 
 		 454 aa  913    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  69.8 
 
 		 456 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 497 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  50.89 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  54.27 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  53.25 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  53.3 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  52.65 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  52.51 
 
 		 759 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  52.14 
 
 		 446 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.4 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  52.76 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  52.26 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  53.88 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  51.22 
 
 		 764 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  49.88 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  53.55 
 
 		 424 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  49.41 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  50.93 
 
 		 441 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  23.88 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.78 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.85 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.85 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  24.48 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.88 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  24.48 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.48 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.08 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.65 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.55 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.48 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.47 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  27.73 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.15 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  24.4 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07290  predicted flavoprotein involved in K+ transport  26.54 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.6 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.16 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  24.8 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.85 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.67 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.5 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  26.11 
 
 		 480 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0149  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.9 
 
 		 320 aa  49.7  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0178346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.73 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.06 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.47 
 
 		 322 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  24.29 
 
 		 558 aa  47.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.84 
 
 		 367 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  28.44 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  27.72 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17600  predicted flavoprotein involved in K+ transport  27.22 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2674  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  47.27 
 
 		 983 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3068  pyruvate dehydrogenase complex, E2 and E3 components  47.27 
 
 		 983 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1811  thioredoxin reductase  23.32 
 
 		 321 aa  44.3  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000441669  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0587  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.01 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0990923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  21.86 
 
 		 361 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>