More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2674 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0652  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.1 
 
 
998 aa  1053    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2109  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  56.7 
 
 
902 aa  964    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.73263  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2674  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  100 
 
 
983 aa  1971    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3068  pyruvate dehydrogenase complex, E2 and E3 components  100 
 
 
983 aa  1971    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 
593 aa  253  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.59 
 
 
625 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1439  hypothetical protein  35.4 
 
 
452 aa  248  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.6 
 
 
619 aa  245  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 
480 aa  244  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 
467 aa  244  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.57 
 
 
599 aa  244  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 
467 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.05 
 
 
467 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.12 
 
 
470 aa  243  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.66 
 
 
467 aa  241  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
484 aa  241  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1831  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.3 
 
 
431 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5611  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.36 
 
 
573 aa  239  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4977  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.35 
 
 
432 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
465 aa  238  4e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.98 
 
 
470 aa  238  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 
589 aa  238  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
593 aa  238  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.13 
 
 
465 aa  237  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1231  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.75 
 
 
426 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1261  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.75 
 
 
426 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.4471  hitchhiker  0.000962445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
685 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21291  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.11 
 
 
439 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.372749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
470 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 
467 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 
467 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
470 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1755  dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase (dihydrolipoamide S-acetyltransferase)  31.59 
 
 
554 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
470 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04241  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.74 
 
 
455 aa  235  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0400  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.07 
 
 
455 aa  234  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
470 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 
594 aa  233  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1739  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.15 
 
 
456 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 
475 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.19 
 
 
470 aa  233  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
605 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 
481 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04561  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.65 
 
 
456 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.852087  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04661  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
455 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
474 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
474 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 
484 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
475 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
474 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1068  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.69 
 
 
431 aa  232  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0808214  hitchhiker  0.00512837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 
579 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
474 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 
474 aa  233  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
588 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
467 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 
467 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
592 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3176  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.92 
 
 
432 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 
467 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.24 
 
 
484 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
680 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 
470 aa  231  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
489 aa  231  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.84 
 
 
463 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
592 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
581 aa  231  6e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0529  pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoamide acetyltransferase  31.24 
 
 
586 aa  231  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315007  normal  0.764749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
474 aa  231  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
474 aa  230  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
474 aa  230  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04551  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.74 
 
 
455 aa  230  8e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.230997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
474 aa  230  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.49 
 
 
463 aa  230  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
479 aa  230  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.34 
 
 
588 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
474 aa  230  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
474 aa  230  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.34 
 
 
588 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
589 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
589 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
495 aa  230  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
588 aa  230  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
480 aa  230  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
474 aa  230  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
589 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
475 aa  230  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
478 aa  230  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.34 
 
 
590 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
495 aa  230  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.91 
 
 
470 aa  230  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
589 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
589 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.13 
 
 
589 aa  229  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
478 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>