80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4494 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
497 aa  969    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  59.59 
 
 
441 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  55.73 
 
 
454 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  52.01 
 
 
456 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  53.58 
 
 
442 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  51.03 
 
 
434 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  50.1 
 
 
759 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 
468 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  54.13 
 
 
468 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  47.44 
 
 
764 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  49.8 
 
 
494 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  53.79 
 
 
451 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  55.14 
 
 
424 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  51.54 
 
 
453 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  52.39 
 
 
445 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  52.27 
 
 
471 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  51.36 
 
 
461 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 
476 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  52.68 
 
 
445 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  50.34 
 
 
446 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  52.1 
 
 
461 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  51.52 
 
 
497 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  53.02 
 
 
453 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 
405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  29.4 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.51 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.62 
 
 
331 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.09 
 
 
362 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.84 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.74 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.86 
 
 
348 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  28.27 
 
 
360 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  23.5 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.68 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
369 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
745 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.71 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.94 
 
 
363 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.27 
 
 
326 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3374  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.98 
 
 
335 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07290  predicted flavoprotein involved in K+ transport  28.49 
 
 
447 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.13 
 
 
456 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.16 
 
 
748 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0375  flavin-containing monooxygenase FMO  31.91 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
329 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1047  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  21.35 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
748 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.08 
 
 
326 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.1 
 
 
326 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  23.08 
 
 
326 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.35 
 
 
334 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.08 
 
 
326 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 
399 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00083188  normal  0.623853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.26 
 
 
377 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  23.08 
 
 
326 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.33 
 
 
361 aa  47  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.46 
 
 
527 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.32 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  23.3 
 
 
326 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.37 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.83243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12483  thioredoxin reductase  21.31 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
553 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2070  Flavin-containing monooxygenase  24.13 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.13 
 
 
455 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.89 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  22.78 
 
 
326 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  22.78 
 
 
326 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1464  Flavin-containing monooxygenase  30.1 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  61.76 
 
 
545 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
517 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
553 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
553 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.9 
 
 
367 aa  43.9  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
553 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.87 
 
 
399 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  27.21 
 
 
357 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  28.37 
 
 
461 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  60 
 
 
480 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>