More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1084 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6076  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  63.59 
 
 
554 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0620  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  68.22 
 
 
563 aa  772    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  77.72 
 
 
552 aa  912    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.44 
 
 
549 aa  773    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0621  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  68.04 
 
 
563 aa  772    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.994915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  66.91 
 
 
553 aa  763    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  75.59 
 
 
553 aa  883    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.41 
 
 
554 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  55.96 
 
 
551 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.5 
 
 
557 aa  721    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.07 
 
 
557 aa  770    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0649  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.84 
 
 
554 aa  760    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
552 aa  1140    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  84.24 
 
 
552 aa  962    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4767  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.78 
 
 
557 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  95.83 
 
 
552 aa  1076    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4247  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.96 
 
 
557 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05315  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.32 
 
 
580 aa  876    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1229  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  92.03 
 
 
552 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3745  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.78 
 
 
549 aa  635    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3268  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.46 
 
 
563 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.545567  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0911  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  66.02 
 
 
568 aa  766    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1091  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  68.95 
 
 
554 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.358633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5421  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  62.68 
 
 
554 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428869  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2658  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.49 
 
 
568 aa  762    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.29 
 
 
557 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0444  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.09 
 
 
557 aa  725    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4617  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.14 
 
 
557 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.04 
 
 
557 aa  695    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  58.77 
 
 
553 aa  701    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3075  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  56.15 
 
 
549 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816418  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.78 
 
 
551 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.15 
 
 
548 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.6 
 
 
551 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.39 
 
 
549 aa  624  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.66 
 
 
549 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.33 
 
 
548 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
581 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  54.87 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
581 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
557 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.87 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.48 
 
 
562 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.6 
 
 
557 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.6 
 
 
557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.09 
 
 
551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.62 
 
 
545 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.43 
 
 
556 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.04 
 
 
561 aa  601  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.35 
 
 
556 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.27 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.87 
 
 
557 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.09 
 
 
556 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.64 
 
 
557 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.87 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.09 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.87 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.91 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.87 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.09 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.09 
 
 
557 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.89 
 
 
557 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.83 
 
 
555 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.69 
 
 
557 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.91 
 
 
557 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.91 
 
 
545 aa  591  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.42 
 
 
557 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.33 
 
 
557 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.59 
 
 
566 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.07 
 
 
561 aa  585  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.05 
 
 
557 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.87 
 
 
563 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55 
 
 
558 aa  585  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.01 
 
 
568 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.82 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.95 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3018  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.88 
 
 
572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0545377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4163  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.88 
 
 
572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  53.66 
 
 
545 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.35 
 
 
560 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.53 
 
 
560 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  53.6 
 
 
562 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2269  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.88 
 
 
587 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.68 
 
 
569 aa  578  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.26 
 
 
550 aa  578  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.52 
 
 
561 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.52 
 
 
561 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.44 
 
 
551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.84 
 
 
533 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2714  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.22 
 
 
558 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  normal  0.490703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  54.63 
 
 
550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.23 
 
 
555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.86 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.64 
 
 
549 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0388  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  50.91 
 
 
549 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.817996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  52.09 
 
 
547 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1192  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.17 
 
 
561 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>