13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1450 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  741    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  37.4 
 
 		 262 aa  93.6  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  30.71 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  31.88 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  30.71 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5586  ATPase  44.74 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3653  ATPas  42.11 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.96179e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  24.68 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02992  hypothetical protein  28.69 
 
 		 521 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000718056  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  29.29 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  29.29 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  23.89 
 
 		 490 aa  46.2  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  25 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>