255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1293 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 541 aa  1088    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  47.45 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  46.25 
 
 		 542 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  44.39 
 
 		 559 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  42.2 
 
 		 558 aa  342  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  41.44 
 
 		 552 aa  339  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  41.85 
 
 		 551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  38.6 
 
 		 518 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  39.42 
 
 		 553 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  40.74 
 
 		 547 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  41.33 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  42.15 
 
 		 526 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  41.14 
 
 		 530 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  41.14 
 
 		 530 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  40.99 
 
 		 534 aa  292  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  37.52 
 
 		 541 aa  289  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  39.45 
 
 		 526 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  38.48 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  38.54 
 
 		 521 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  37.16 
 
 		 520 aa  256  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  37.55 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  36.26 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  39.11 
 
 		 498 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  36.96 
 
 		 563 aa  237  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  38.23 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.44 
 
 		 522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.54 
 
 		 540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  27.52 
 
 		 553 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 539 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.7 
 
 		 562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.94 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 499 aa  107  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.27 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  25.75 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.52 
 
 		 533 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  23.43 
 
 		 548 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.52 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.95 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 527 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  22.61 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  27.13 
 
 		 540 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  21.69 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  22.54 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  21.85 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  24.3 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 556 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  26.15 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  25.31 
 
 		 619 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  21.55 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.93 
 
 		 574 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  20.96 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 538 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.25 
 
 		 557 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  21.76 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  21.65 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  21.65 
 
 		 522 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  21.85 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  21.46 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  21.46 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  23.81 
 
 		 557 aa  90.5  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  22.85 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.7 
 
 		 560 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11990  hypothetical protein  32.52 
 
 		 361 aa  89.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.340317  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 492 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.23 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  24.73 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  25.15 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  22.87 
 
 		 543 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.28 
 
 		 563 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  22.27 
 
 		 520 aa  88.2  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 584 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.83 
 
 		 556 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  27.46 
 
 		 505 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  23.08 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.05 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  22.99 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.59 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  23.72 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  24.08 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.15 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  26.26 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  39.68 
 
 		 266 aa  83.2  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.43 
 
 		 565 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  24.79 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.2 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  26.07 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  21 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  22.44 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  24.94 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  20.24 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  23.44 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  24.67 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 544 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  24.39 
 
 		 569 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>