More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2521 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2521  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0205  LysR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0306  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1124  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 288 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.53 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283636  hitchhiker  0.00259911 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0805  transcriptional regulator LysR family  36.92 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0971  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0661405  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0403  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.14 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0653  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1898  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1478  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4030  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653642  normal  0.928184 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  31.18 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3298  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.683062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4156  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.638472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 328 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 328 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2385  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 289 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0716599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 307 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  28.42 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.6 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0572  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1441  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 		 306 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 315 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.55 
 
 		 289 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1154  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4165  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  26.43 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1552  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0365883  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  24.74 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0448  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3798  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.244352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3911  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0979  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  24.57 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  24.74 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6141  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2448  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  29.78 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0876  transcriptional regulator, LysR family  29.14 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6201  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01514  transcriptional regulatory protein  24.91 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3308  transcription regulator protein  27.72 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1199  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4214  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3433  transcriptional regulator LysR family  28.67 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0071  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328388  hitchhiker  0.00942011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  27.11 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0055  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  29.29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0074  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183793  hitchhiker  0.0000000265009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3786  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>