136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1439 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 
460 aa  964    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  85.22 
 
 
451 aa  829    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  77.04 
 
 
453 aa  738    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  77.04 
 
 
453 aa  738    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  83.48 
 
 
451 aa  814    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.82 
 
 
453 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  67.37 
 
 
448 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.25 
 
 
453 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.35 
 
 
453 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.16 
 
 
448 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.11 
 
 
448 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.81 
 
 
455 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.57 
 
 
448 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.64 
 
 
448 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.64 
 
 
449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.29 
 
 
450 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.34 
 
 
452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.32 
 
 
453 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.83 
 
 
453 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.27 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.76 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.34 
 
 
440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.76 
 
 
448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.29 
 
 
468 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.35 
 
 
444 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.35 
 
 
444 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.29 
 
 
448 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.2 
 
 
444 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.89 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.21 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.12 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.66 
 
 
434 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.25 
 
 
430 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.4 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  53 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.72 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.55 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.53 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  53 
 
 
448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04215  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.57 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.36 
 
 
450 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.55 
 
 
432 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
444 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.02 
 
 
437 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.55 
 
 
432 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.87 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.2 
 
 
433 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0910  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.09 
 
 
431 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.97 
 
 
433 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.2 
 
 
433 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.2 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  50.93 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  50.35 
 
 
454 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  50.92 
 
 
443 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  50.95 
 
 
442 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.27 
 
 
443 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.77 
 
 
434 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.88 
 
 
434 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15350  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.53 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.08 
 
 
438 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.37 
 
 
441 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  46.9 
 
 
448 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.29 
 
 
429 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.54 
 
 
416 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.31 
 
 
416 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  41.19 
 
 
462 aa  339  5e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  41.72 
 
 
494 aa  325  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.96 
 
 
848 aa  309  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  40.05 
 
 
458 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04012  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 
533 aa  249  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.01 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.99 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.91 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.59 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.36 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  25.85 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  23 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.89 
 
 
386 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  24.31 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.08 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.51 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.04 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.89 
 
 
386 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  25.47 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  25.17 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  25.17 
 
 
386 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 
390 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  26.04 
 
 
385 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  25.87 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  26.04 
 
 
385 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  24.48 
 
 
386 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  23.02 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  24.44 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.24 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>