More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1514 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  835    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.87 
 
 
432 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  27.27 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  26.28 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.64 
 
 
420 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  29.96 
 
 
411 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.19 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.37 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.37 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  25.57 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.84 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.64 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  28.16 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.78 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  31.36 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.37 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.21 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.41 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  29.06 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.65 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  27.35 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.71 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  25.27 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.21 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.37 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  26.02 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.62 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  22.68 
 
 
900 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  22.68 
 
 
914 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.24 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  23.68 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  22.68 
 
 
900 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.29 
 
 
723 aa  67  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.72 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  27.09 
 
 
319 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  27.09 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  25.62 
 
 
425 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.15 
 
 
924 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  31.74 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23 
 
 
926 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  26.32 
 
 
912 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.49 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.12 
 
 
414 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  24.23 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.89 
 
 
896 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  26.34 
 
 
904 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.89 
 
 
904 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.68 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  24.44 
 
 
756 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.89 
 
 
894 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  30.3 
 
 
543 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.05 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.35 
 
 
428 aa  60.1  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3101  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.69 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  26.6 
 
 
319 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3613  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.69 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  22.22 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  24.91 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.29 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862074 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.85 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.29 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  25.93 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.76 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  25.39 
 
 
399 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  26.74 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  23.53 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  23.53 
 
 
318 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.49 
 
 
891 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  26.03 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  23.56 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  23.53 
 
 
318 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  23.53 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  23.9 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.77 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  25.33 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  23.62 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2550  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.64 
 
 
1067 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.42 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2678  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.46 
 
 
1067 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  21.89 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.03 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  23.86 
 
 
319 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  21.89 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  25.39 
 
 
721 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.31 
 
 
423 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  19.93 
 
 
401 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  27.78 
 
 
410 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0146  D-alanine--D-alanine ligase  26.95 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.302602  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1063  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.32 
 
 
1110 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0872  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.14 
 
 
1075 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  24.41 
 
 
314 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4090  acetyl CoA carboxylase, biotin carboxylase subunit  24.27 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  23.65 
 
 
306 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3425  D-alanine--D-alanine ligase  23.89 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.346126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1011  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  23.77 
 
 
397 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.18 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  24.12 
 
 
319 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.45 
 
 
541 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3300  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.17 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  26.83 
 
 
353 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>